Sus principales líneas de investigación relacionan asuntos como migraciones transnacionales, desigualdades, emociones sociales, diversidad familiar (familia transnacional, controversias morales sobre aborto, migración calificada, infancia en movimiento, patrimonio inmaterial migrante y pautas de crianza).
El detalle de sus distintas publicaciones se puede ver en: https://academiacl.academia.edu/JavieraCienfuegosIllanes
